个人所得税计算公式为：应纳税所得额 = 税前收入 - 各项扣除费用，应纳税额 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数。

假设某人税前收入为10000元，各项扣除费用为3000元，则应纳税所得额为10000-3000=7000元。按照税率表，该纳税人应适用的税率为20%，速算扣除数为560元。因此，该纳税人应缴纳的个人所得税为7000×20%-560=640元。

实际计算过程中，还可以使用个税APP等工具，方便快捷地计算出个人所得税。